某市进行政府机构改革，将原来的科技和信息局、贸易和工业局、市高新办、市保税区管理局、市信息化管理办公室等多个部门合并，成立“科技工贸和信息化委员会”。改革之后，原来的职能没有变，岗位设置也没有变，机构一下予变得很庞大，人员也很多，部门领导职数竟然达到“1正20副”之多。现任领导大多是直接从原来的部门合并过来的，到新的部门之后，新的机构仍需要有人管科技、管信息、管贸易、管工业、管高新技术，还有保税区管理等。“原来管哪块的，现在还管哪块”，所以就有了现在这样一个 “大拼盘”。目前，一些地方大部制改革仍处于浅层次的简单拼贴组合阶段，机构、人员设置上并没有很好地深度融合。难怪有人质疑：“都说政府要转变职能，精简机构，提高行政效率，这样的‘大拼盘’，是不是和现在所说的政府机构改革方向相符合呢?”
问题：
(1)从行政职能与机构改革关系的角度，分析该市政府机构改革存在问题的原因。
(2)根据材料的启示，谈谈如何理顺政府内部各职能机构间的关系。
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